בשנת 1979, מתוך תחושת שליחות עמוקה וברוח היוגה, נוסד ארגון מורי היוגה בישראל. היוזמה יצאה לדרך בהשראתה ובהובלתה של רחל זולברג, מורה מוערכת ופורצת דרך, שכיהנה מאז ועד היום כנשיאת כבוד של הארגון. סוואמי וונקטסננדה ודסיקשאר, שניים ממורי היוגה הבולטים בזמנם, ליוו ותמכו בהקמה, והארגון נבנה באישור ובברכת ארגון מורי היוגה האירופאי.
מאז ועד היום, הארגון הוא הבית המקצועי של מורות ומורי יוגה בישראל – קהילה פעילה, קשובה ומתרחבת, שמובילה תהליכים ומחזקת שורשים. לאורך השנים עמדו בראשו מורות ומורים שהובילו את דרכו ברוח מסורת היוגה והתרגול העכשווי גם יחד: אדי בכור, רינה טוויל, זיוה כנרות ז"ל, ציפי נגב, אילנה פיורסקי, סימה צ’נדרשיקר, דולה כספי, תמר מרנין וסיגל רן. כיום, מכהנת כיו"ר הארגון הני רוזן.
כעמותה ללא מטרות רווח, הארגון פועל בשקיפות ומתוך מחויבות עמוקה לקידום תחום היוגה בישראל. דמי החבר מוקדשים באופן מלא לתמיכה בפעילות הארגון וקידום מטרותיו. כל חברות וחברי הארגון זכאים להשתתף באסיפה הכללית, להצביע, לבחור ולהיבחר לוועדות השונות.
הארגון מנוהל על ידי צוות קטן: מנכ"לית ומנהלת אדמיניסטרטיבית, בעוד הוועדות השונות ויו"ר הארגון פועלים בהתנדבות מלאה. הבחירות לתפקידים בוועדות העמותה מתקיימות אחת לשלוש שנים.